Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ykt6Q9CQW1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms