Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Chchd5Q9CQP3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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