Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl20Q9CQL4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms