Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms