Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znhit3Q9CQK1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Znhit3Q9CQK1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms