Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Higd2aQ9CQJ1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd2aQ9CQJ1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms