Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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