Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms