Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms