Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms