Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup155Q99P88 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms