Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms