Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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