Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms