Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms