Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tm2d1Q99MB3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms