Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms