Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms