Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms