Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms