Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms