Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pacsin3Q99JB8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pacsin3Q99JB8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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