Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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