Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarca5Q91ZW3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms