Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rab29Q91YQ1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rab29Q91YQ1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rab29Q91YQ1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rab29Q91YQ1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab29Q91YQ1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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