Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms