Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhbdd2Q8VEK2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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