Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf4Q8VE97 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms