Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms