Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms