Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ssh3Q8K330 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ssh3Q8K330 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ssh3Q8K330 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ssh3Q8K330 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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