Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc12Q8K2L8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc12Q8K2L8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms