Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms