Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms