Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms