Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

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Length 1,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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