Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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