Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE3

Rcor1, REST corepressor 1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcor1Q8CFE3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rcor1Q8CFE3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rcor1Q8CFE3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rcor1Q8CFE3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rcor1Q8CFE3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rcor1Q8CFE3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rcor1Q8CFE3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rcor1Q8CFE3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rcor1Q8CFE3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rcor1Q8CFE3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcor1Q8CFE3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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