Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ercc8Q8CFD5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ercc8Q8CFD5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ercc8Q8CFD5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ercc8Q8CFD5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ercc8Q8CFD5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ercc8Q8CFD5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ercc8Q8CFD5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ercc8Q8CFD5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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