Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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