Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms