Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms