Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms