Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrip1Q8CBD1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms