Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sit1Q8C503 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sit1Q8C503 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms