Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms