Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FarsaQ8C0C7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FarsaQ8C0C7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FarsaQ8C0C7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FarsaQ8C0C7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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