Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim35Q8C006 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim35Q8C006 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Trim35Q8C006 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Trim35Q8C006 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trim35Q8C006 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trim35Q8C006 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trim35Q8C006 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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