Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms