Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup54Q8BTS4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms